Particulièrement anthropisé, le bassin de la Seine est soumis à une très forte pression urbaine, dont les impacts sur l’eau et l’environnement sont étudiés depuis des décennies au PIREN-Seine. Les travaux portant sur le milieu urbain sont donc nombreux : fonctionnement du fleuve sous influence urbaine, interactions entre le fleuve et la ville, usages de l’eau, acquisition et utilisation de nouvelles données pour de meilleures simulations de la qualité de l’eau et des milieux, etc. Elément central du socio-écosystème Seine, le système d'assainissement de l'agglomération parisienne fait également l'objet d'une attention particulière, face aux capacités de dilution limitées de la Seine.
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