Anne Laure Vivant et al.
Normandie Université, EPHE Sorbonne Université CNRS, INSERM, Université Limoges, Paris Diderot
DOI
https://doi.org/10.26047/PIREN.rapp.ann.2021.vol34
Résumé
Le suivi des marqueurs chimiques et bactériens de la dissémination de l’antibiorésistance dans l’environnement, préconisé par l’ANSES (2021), a été réalisé dans les sédiments, les biofilms et l’ichtyofaune d’une rivière urbanisée : l’Orge. Les résultats montrent que les biofilms et les sédiments sont des zones de piégeage d’entérobactéries ATBr (antibiorésistantes) et d’intégrons cliniques. Toutefois, bien que ces bactéries ATBr ne s’y maintiennent pas, leurs génomes, dont les intégrons cliniques, semblent persister plus longtemps sans pour autant s’y accumuler. Les contaminants chimiques (antibiotiques (ATB), pesticides (biocides et produits phytosanitaires)), susceptibles de favoriser le maintien, voire l’émergence de bactéries ATBr, sont détectés avec des profils de contamination qui diffèrent selon les matrices. Toutefois, il n’y a pas de relation entre les profils de résistance aux ATB des E. coli isolés des biofilms et des sédiments et la contamination en ATB de ces matrices. Le déterminisme de cette contamination est complexe et, à ce stade de l’exploitation des résultats, il n’a pas pu être établi de relation simple avec la pluviométrie ou le débit. Les premiers résultats obtenus sur des poissons encagés en aval à proximité des rejets filtrés d’une STEU (Ollainville) montrent que l’exposition des poissons dans cette zone de rejet affecte la proportion d’entérobactéries du microbiote cutané, et que ces poissons sont porteurs d’entérobactéries et de Pseudomonas (bactéries pathogènes opportunistes) résistantes aux ATB.
Points clefs
✓ Les biofilms et les sédiments sont des zones de piégeage d’entérobactéries ATBr, dans ces matrices, les bactéries ATBr ne se maintiennent pas, même si leurs génomes dont les intégrons cliniques, semblent persister plus longtemps
✓ Les profils de contamination en ATB et pesticides diffèrent selon les matrices, et il n’y a pas de relation entre les profils de résistance aux antibiotiques des E. coli et la contamination en ATB des biofilms et des sédiments
✓ Les goujons sont porteurs d’entérobactéries et de Pseudomonas, résistantes aux ATBs.
