L'antimoine, un polluant émergent dans les sols et rivières urbaines : évolution de la diversité et structure des communautés microbiennes totales et

Auteur.e.s

Claire Da Costa et al.

Université

Normandie Université, IPSL, Sorbonne Université, CNRS, MNHN, Université Montpellier, Synchrotron SOLEIL, IRD

DOI
https://doi.org/10.26047/PIREN.rapp.ann.2022.vol23

Résumé

Cette action a pour objectif d’étudier l’impact d’un contaminant émergent en milieu urbain, l’antimoine (Sb), sur les milieux récepteurs accumulant cette contamination. La diversité des communautés microbiennes totale et active des sédiments du bassin de rétention de Bréthencourt a été étudiée par une approche de méta-taxonomique. Ces deux communautés ont plus de 90% des variants de séquences d’amplicon (ASV) identifiés en commun. Une analyse en coordonnées principales (PCoA) montre que les communautés bactériennes sont bien différenciées au sein des échantillons prélevés le long du continuum route-bassin, mais qu’il n’y a pas de variation significative entre les communautés totales et actives à l’échelle des variants de séquences d’amplicon (ASV). Les communautés microbiennes totales sont majoritairement représentées par des Bacteroidota et Proteobacteria (classes α- et γ-), qui ne constituent pas nécessairement les taxons métaboliquement actifs majoritaires. Des taxons métaboliquement actifs potentiellement impliqués dans les processus de réduction (Dechloromonas) et oxydation (Hydrogenophaga, Thiobacillus, Bradyrhizobium) de Sb ont pu être identifiés et pourraient être responsables des différences de spéciation observées entre les échantillons au sein du continuum route-bassin. Dans ces échantillons, des genres bactériens, connus pour posséder des mécanismes de résistance à Sb et/ou As, ont également pu être identifiés au sein des communautés actives.


Points clefs

  • Au sein du bassin de rétention, la structure des communautés microbiennes diffère le long du continuum route-bassin ;
  • Les communautés microbiennes totales sont majoritairement représentées par des Bacteroidota et Proteobacteria (classes α et γ) qui ne constituent pas nécessairement les taxons métaboliquement actifs majoritaires ;
  • Les sédiments du bassin de rétention hébergent des micro-organismes qui sont décrits pour intervenir dans la spéciation du Sb et/ou posséder des mécanismes qui confèrent une résistance à ce métalloïde.

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