S’inscrivant dans une dynamique de temps long et de vision globale, les recherches du PIREN-Seine ont amené à s’interroger sur l’impact des activités humaines depuis plus de 150 ans, en questionnant les différentes normes de qualité régulant la qualité de l’eau et des milieux. Etudes d'archives naturelles tels que les sédiments, ou d'archives papiers comme les cartes ou les registres, les trajectoires du bassin sont traitées sous divers angles, afin de comprendre les dynamiques et les leviers qui influent sur la gestion de l’eau du bassin de la Seine.